Como conciliar o R-2010 com as notas de serviço tomadas do mês?

Discordo em um ponto: nem sempre o erro está na busca. Bem, para variar, a causa que costuma aparecer é a retenção lançada direto na contabilidade, sem passar pelo registro do documento. Nesse caso o imposto existe no razão e não existe na base da apuração, então nenhuma configuração de busca resolve. Teste simples: pegue uma nota que sobrou na sua lista e confira se a retenção dela nasceu no documento ou num lançamento manual de FI. Se foi manual, o ajuste é de processo, não de parâmetro.

Direto: comece pelo documento, não pelo evento. Veja, o combinado é este roteiro:

1. Liste as notas de serviço do mês que deveriam entrar, com o Docnum de cada uma.
2. Confira se cada uma foi registrada pela MIRO ou por fatura em FI, porque a documentação da NTT cita isso como pré-requisito.
3. Compare o total retido da lista com o total do R-2010 por prestador.
4. Anote as notas que sobraram de cada lado.

A diferença costuma cair numa lista pequena, e dela sai a causa.

Bem, como bem lembrou o Alan, o roteiro começa no documento. Só completando com o que costuma travar: a busca de documentos. Segundo a documentação da NTT, ela precisa estar bem configurada para não faltar documento, e a busca complementar tem limite de dias corridos, no máximo 15 dias considerando o vencimento do imposto. Se a nota entrou fora dessa janela, ela some do evento e o valor não bate. Aqui eu abro o log da apuração e procuro a nota que está na lista mas não está no evento.