O material tem NCM correta no cadastro e a nota sai com tributação errada. Cadastro, regra ou dado do parceiro?

Discordo de tratar as três causas como igualmente prováveis. O ponto é que, tá, a NCM é só uma das entradas do cálculo: a regra também lê o tipo de operação e a data, e se esses dados vieram errados da nota de venda, nem cadastro nem regra estão errados. Confira primeiro o que a nota de venda trouxe. Sobre o produto: segundo a descrição que consultamos, ele não corrige dado mestre ruim, então cadastro ou parceiro errado não se resolve com configuração.

No fechamento, pois é, o que mais custa é descobrir tarde. Complemento: depois de achar a causa, procure outras notas do mesmo período com a mesma combinação de material e parceiro. Se o erro é de cadastro de um parceiro, provavelmente há outras notas dele com o mesmo problema. Liste todas e leve ao responsável pelo tributário, que decide o tratamento do que já foi emitido.

Isole variando uma coisa por vez, a partir da mesma nota. Com a mão na massa, pois é, o passo a passo:

1. Pegue uma nota errada e anote material, parceiro, UF de origem e destino, tipo de operação e a tributação que saiu.
2. Simule o mesmo material com outro parceiro de teste: se a tributação mudar, o problema está no dado do parceiro.
3. Simule outro material com o mesmo parceiro: se mudar, o material tem algo além da NCM.
4. Se nada mudar, a regra é a suspeita.

Anote o resultado de cada passo.

Bem, pra constar, uma forma diferente é começar pela comparação com uma nota certa. Ache uma nota recente do mesmo material, ou de um parecido, com tributação correta, e compare campo a campo com a errada: parceiro, UF, tipo de operação, CFOP, data. A diferença entre elas é a pista. Aqui o que mais apareceu foi um dado de parceiro diferente entre as duas, e a NCM nunca era o problema. Isso é experiência de campo, não regra: no seu caso a diferença pode estar em outro campo.